| 科名番号 | 和名 | 学名 | 科名 | Family | 写真 |
| 155401123 | サイゴクベニシダ | Dryopteris championii C.Chr. ex Ching | オシダ | Dryopteridaceae | |
| 171123140 | ザイフリボク | Amelanchier asiatica Endl. | バラ | Rosaceae | |
| 171119110 | サカキ | Cleyera japonica Thunb. | ツバキ | Camelliaceae | |
| 171208140 | サギゴケ | Mazus miquelii Makino | ゴマノハグサ | Scrophulariaceae | |
| 172114010 | サギソウ | Habenaria radiata Spreng. | ラン | Orchidaceae | |
| 171123140 | サクラｓｐ | Prunus sp. | バラ | Rosaceae | |
| 171203030 | サクラソウ | Primula sieboldii E.Morren | サクラソウ | Primulaceae | photo1 |
| 171112010 | サクラタデ | Persicaria conspicua (Nakai) Nakai | タデ | Polygonaceae | |
| 171106010 | サクラバハンノキ | Alnus trabeculosa Hand.-Mazz. | カバノキ | Betulaceae | photo1 |
| 171136070 | ザクロ | Punica granatum L. | ザクロ | Punicaceae | |
| 171113050 | ザクロソウ | Mollugo pentaphylla L. | ザクロソウ | Molluginaceae | |
| 172107010 | ササガヤ | Microstegium japonicum (Miq.) Koidz. | イネ | Gramineae | |
| 172101010 | サジオモダカ | Alisma plantago-aquatica L. var. orientale Juzep. | オモダカ | Alismataceae | |
| 171112010 | サデクサ | Persicaria maackiana (Regel) Nakai | タデ | Polygonaceae | |
| 171115020 | サネカズラ | Kadsura japonica (Thunb.)Dunal | マツブサ | Schisandraceae | |
| 171116010 | サラシナショウマ | Cimicifuga simplex Wormsk. | キンポウゲ | Ranunculaceae | |
| 172103010 | サルトリイバラ | Smilax china L. | ユリ | Liliaceae | |
| 171119150 | サワオトギリ | Hypericum pseudopetiolatum Kell. | オトギリソウ | Guttiferae | |
| 171211010 | サワギキョウ | Lobelia sessilifolia Lamb. | キキョウ | Campanulaceae | photo1 photo2 |
| 171211080 | サワシロギク | Aster rugulosus Maxim. | キク | Asteraceae | |
| 171211080 | サワヒヨドリ | Eupatorium lindleyanum DC. | キク | Asteraceae | photo1 photo2 photo3 |
| 171205060 | サワフタギ | Symplocos chinensis Druce f. pilosa Ohwi | ハイノキ | Symplocaceae | |
| 171116010 | サンインシロカネソウ | Dichocarpum ohwianum Tamura et Lauener | キンポウゲ | Ranunculaceae | |
| 171208090 | サンインヒキオコシ | Rabdosia shikokiana Hara var. occidentalis Hara | シソ | Labiatae | |
| 171127010 | サンショウ | Zanthoxylum piperitum DC. | ミカン | Rutaceae | |
| 171106020 | シイ | Castanopsis cuspidata (Thunb.) Schottky | ブナ | Fagaceae | |
| 172112010 | シカクイ | Eleocharis wichurae Bocklr. | カヤツリグサ | Cyperaceae | |
| 171123180 | シカクマメ | Psophocarpus tetragonolobus DC. | マメ | Leguminosae | photo1 |
| 171116010 | シギンカラマツ | Thalictrum actaefolium Sieb. et Zucc. | キンポウゲ | Ranunculaceae | |
| 155401125 | シケシダ | Deparia japonica M.Kato | メシダ | Athyriaceae | |
| 171123060 | シコクウツギ | Philadelphus satsumi Sieb. ex Lindl. et Paht. var. lancifolius (Uyeki) Kitamura et Murata | ユキノシタ | Saxifragaceae | |
| 155401121 | シシガシラ | Struthiopteris niponica Nakai | シシガシラ | Blechnaceae | |
| 171208090 | シソ | Perilla frutescens Britt. var. crisoa Decne. | シソ | Labiatae | |
| 171115010 | シデコブシ | Magnolia stellata Maxim. | モクレン | Magnoliaceae | |
| 171208090 | シナノアキギリ | Salvia koyamae Makino | シソ | Labiatae | |
| 172107011 | シブヤザサ | Pleioblastus shibuyanus Makino ex Nakai | タケ亜 | Bambusacecae | |
| 171211080 | シマカンギク | Dendranthema indicum Des Moulins | キク | Asteraceae | |
| 172103010 | シマラッキョウ | Allium | ユリ | Liliaceae | |
| 171123140 | シモツケ | Spiraea japonica L.fil. | バラ | Rosaceae | |
| 171123140 | シモツケ？ | Spiraea sp. | バラ | Rosaceae | |
| 171123140 | シモツケソウ | Filipendula multijuga Maxim. | バラ | Rosaceae | |
| 171208090 | シモバシラ | Keiskea japonica Miq. | シソ | Labiatae | |
| 172103130 | シャガ | Iris japonica Thunb. | アヤメ | Iridaceae | |
| 171112010 | シャクチリソバ | Fagopyrum dibotrys (D.Don) H.Hara* | タデ | Polygonaceae | |
| 171202030 | シャシャンボ | Vaccinium bracteatum Thunb. | ツツジ | Ericaceae | |
| 172103010 | ジャノヒゲ | Ophiopogon japonicus (L.f.) Ker-Gawl. | ユリ | Liliaceae | |
| 171123140 | シャリンバイ | Rhaphiolepis umbellata Makino | バラ | Rosaceae | |
| 171116010 | シュウメイギク | Anemone hupehensis Lemoine var. japonica Bowles et Stearn* | キンポウゲ | Ranunculaceae | |
| 172114010 | シュンラン | Cymbidium goeringii Reichb.fil. | ラン | Orchidaceae | |
| 172113020 | ショウガ | Zingiber officinale Rosc. | ショウガ | Zingiberaceae | |
| 172103010 | ショウジョウバカマ | Heloniopsis orientalis C.Tanaka | ユリ | Liliaceae | |
| 171206010 | ショウドシマレンギョウ | Forsythia togashii Hara | モクセイ | Oleaceae | |
| 172110010 | ショウブ | Acorus calamus L. | サトイモ | Araceae | photo1 photo2 |
| 172103010 | ジョウロウホトトギス | Tricyrtis macrantha Maxim. | ユリ | Liliaceae | |
| 171106020 | シラカシ | Quercus myrsinaefolia Bl. | ブナ | Fagaceae | |
| 171126080 | シラキ | Sapium japonicum Pax et Hoffm. | トウダイグサ | Euphorbiaceae | photo1 photo2 |
| 172112010 | シラサギスゲ | Dichromena | カヤツリグサ | Cyperaceae | photo1 photo2 |
| 172114010 | シラン | Bletilla striata Reichb.fil. | ラン | Orchidaceae | photo1 |
| 172106050 | シロイヌノヒゲ | Eriocaulon sikokianum Maxim. | ホシクサ | Eriocaulaceae | photo1 |
| 172103010 | シロウマアサツキ | Allium schoenoprasum L. var. orientale Regel | ユリ | Liliaceae | photo1 |
| 171113110 | シロザ | Chenopodium album L. | アカザ | Chenopodiaceae | |
| 171123180 | シロツメクサ | Trifolium repens L.* | マメ | Leguminosae | |
| 171202030 | シロドウダン | Enkianthus cernuus Makino | ツツジ | Ericaceae | |
| 171119110 | シロノチリツバキ | Camellia | ツバキ | Camelliaceae | |
| 171202030 | シロバナウンゼンツツジ | Rhododendron serpyllifolium Miq. f. albiflorum Hara | ツツジ | Ericaceae | photo1 |
| 172114010 | シロバナシラン | Bletilla striata (Thunb.) Reichb. fil. f. gebina Ohwi | ラン | Orchidaceae | |
| 172103010 | シロバナホトトギス | Tricyrtis affinis Makino f. albida Okuyama | ユリ | Liliaceae | |
| 172103070 | シロバナマンジュシャゲ | Lycoris albiflora Koidz. | ヒガンバナ | Amaryllidaceae | |
| 171210010 | シロバナヤブウツギ | Weigela floribunda k.Koch f. leucantha Honda | スイカズラ | Caprifoliaceae | |
| 171123140 | シロヤマブキ | Rhodotypos scandens Makino | バラ | Rosaceae | |
| 171211080 | シロヨメナ | Aster ageratoides Turcz. subsp. leiophyllus Kitam. | キク | Asteraceae | |
| 171123060 | ジンジソウ | Saxifraga cortusaefolia Sieb. et Zucc. | ユキノシタ | Saxifragaceae | |
| 171210010 | スイカズラ | Lonicera japonica Thunb. | スイカズラ | Caprifoliaceae | photo1 |
| 171123060 | ズイナ | Itea japonica Oliver | ユキノシタ | Saxifragaceae | |
| 171112010 | スイバ | Rumex acetosa L. | タデ | Polygonaceae | photo1 |
| 171211080 | スイラン | Hololeion krameri Kitam. | キク | Asteraceae | photo1 photo2 |
| 171121030 | スカシタゴボウ | Rorippa islandica (Oeder) Borb. | アブラナ | Brassicaceae | |
| 162109060 | スギ | Cryptomeria japonica D.Don | スギ | Taxodiaceae | |
| 154105010 | スギナ | Equisetum arvense L. | トクサ | Equisetaceae | photo1 |
| 172107010 | ススキ | Miscanthus sinensis Anderss. | イネ | Gramineae | |
| 171207060 | スズサイコ | Cynanchum paniculatum Kitag. | ガガイモ | Asclepiadaceae | |
| 171208180 | スズムシバナ | Strobilanthes oliganthus Miq. | キツネノマゴ | Acanthaceae | |
| 171135010 | スズメウリ | Melothria japonica (Thunb.) Maxim. | ウリ | Cucurbitaceae | photo1 photo2 |
| 171123180 | スズメノエンドウ | Vicia hirsuta (L.) S.F.Gray | マメ | Leguminosae | |
| 172107010 | スズメノカタビラ | Poa annua L. | イネ | Gramineae | photo1 |
| 172104010 | スズメノヤリ | Luzula capitata (Miq.)Miq. | イグサ | Juncaceae | photo1 |
| 171116010 | スハマソウ | Anemone hepatica L. f. variegata Kitam. | キンポウゲ | Ranunculaceae | |
| 171113070 | スベリヒユ | Portulaca oleracea L. | スベリヒユ | Portulacaceae | |
| 171134030 | スミレ | Viola mandshurica W.Beck. | スミレ | Violaceae | photo1 photo2 |
| 171211080 | セイタカアワダチソウ | Solidago altissima L.* | キク | Asteraceae | |
| 172107010 | セイタカヨシ | Phragmites vallatoria (L.) Veldkamp | イネ | Gramineae | |
| 171211080 | セイヨウタンポポ | Taraxacum officinale Weber* | キク | Asteraceae | |
| 171123140 | セイヨウヤブイチゴ | Rubus fruticosus Agg.* | バラ | Rosaceae | |
| 171208090 | セキヤノアキチョウジ | Rabdosia effusa Hara | シソ | Labiatae | |
| 172103010 | セトウチホトトギス | Tricyrtis setouchiensis Hr.Takahashi | ユリ | Liliaceae | |
| 171137070 | セリ | Oenanthe javanica (Blume) DC. | セリ | Apiaceae | |
| 171116010 | セリバオウレン | Coptis japonica Makino var. dissecta Nakai | キンポウゲ | Ranunculaceae | |
| 171127060 | センダン | Melia azedarach L. | センダン | Meliaceae | |
| 155301010 | ゼンマイ | Osmunda japonica Thunb. | ゼンマイ | Osmundaceae | photo1 photo2 |
| 171211010 | ソバナ | Adenophora remotiflora Miq. | キキョウ | Campanulaceae | |
| 171130030 | ソヨゴ | Ilex pedunculosa Miq. | モチノキ | Aquifoliaceae |